蛋白質(zhì)結(jié)構的推測與測定
1、一級結(jié)構測定
蛋白質(zhì)一級結(jié)構的測定又稱蛋白質(zhì)順序分析，其基本方法是：①應用化學裂解法和蛋白酶水解法將多肽鏈專一性裂解。②逐一測定每個純化的小肽段的順序。③根據(jù)肽段氨基酸順序中的重疊區(qū)確定小肽段的排列次序。④完成整條多肽鏈的順序分析。
盡管蛋白質(zhì)順序分析已經(jīng)自動化，但仍然耗時、復雜并且昂貴。重組DNA技術出現(xiàn)后，人們可以從cDNA或基因序列直接推導出蛋白質(zhì)的氨基酸順序，速度快且經(jīng)濟，已成為zui常用的測定蛋白質(zhì)一級結(jié)構的方法?！?br />2、蛋白質(zhì)結(jié)構預測
蛋白質(zhì)三維結(jié)構很大程度上決定了蛋白質(zhì)的功能，目前應用X射線晶體衍射圖譜法和核磁共振法已測定出1萬多種蛋白質(zhì)及其復合物的結(jié)構，但與已測得的30多萬種蛋白質(zhì)序列相比，還有很大的差距，大大地影響了人們對蛋白質(zhì)結(jié)構和功能關系的研究。因此發(fā)展一種不依賴實驗而又有一定準確性的蛋白質(zhì)結(jié)構預測方法顯得格外重要，近年來在這個方面取得了很多重要的成果。
蛋白質(zhì)結(jié)構的理論預測方法都是建立在氨基酸的一級結(jié)構決定結(jié)構的理論基礎上，大致分為以下三類?！?br />（1）比較建模法又稱為同源結(jié)構預測，是根據(jù)大量已知的蛋白質(zhì)三維結(jié)構來預測序列已知而結(jié)構未知的蛋白質(zhì)結(jié)構?！?br />（2）反向折疊法反向折疊法是近年來發(fā)展起來的一種比較新的方法。它可以應用到?jīng)]有同源結(jié)構的情況下，且不需要預測二級結(jié)構，直接預測三級結(jié)構，從而可以繞過現(xiàn)階段二級結(jié)構預測準確性不超過65％的限度，是一種有潛力的預測方法?！?br />（3）從頭預測法從理論上說，從頭預測法是zui為理想的蛋白質(zhì)結(jié)構預測方法。它要求方法本身可以只根據(jù)蛋白質(zhì)的氨基酸序列來預測蛋白質(zhì)的二級結(jié)構和結(jié)構，但現(xiàn)在還不能*達到這個要求?！?br />根據(jù)對天然蛋白質(zhì)結(jié)構與功能分析建立起來的數(shù)據(jù)庫里的數(shù)據(jù)，可以預測一定氨基酸序列肽鏈空間結(jié)構和生物功能；反之也可以根據(jù)特定的生物功能，設計蛋白質(zhì)的氨基酸序列和空間結(jié)構。通過基因重組等實驗可以直接考察分析結(jié)構與功能之間的關系?！?br />3、蛋白質(zhì)三維結(jié)構實驗測定
根據(jù)蛋白質(zhì)的狀態(tài)，測定蛋白質(zhì)三維結(jié)構的方法分為兩大類：①應用X射線晶體衍射圖譜法和中子衍射法測定晶體中的蛋白質(zhì)分子構象。②應用核磁共振法、園（圓）二色性光譜法、激光拉曼光譜法、熒光光譜法、紫外差光譜法和氫同位素交換法等測定溶液中的蛋白質(zhì)構象?！?br />其他方法可以測定溶液中蛋白質(zhì)分子的局部構象，但很難獲得蛋白質(zhì)分子完整的三維結(jié)構，在應用上存在較大的局限性。
在線客服
